История Фонда начинается с 2006 года. На протяжении всей своей деятельности ИИФ СО является элементом региональной инфраструктуры поддержки инновационного предпринимательства и выступает инструментом Правительства Самарской области по поддержке инновационной деятельности на территории региона.

Фонд занимается экспертизой, отбором и сопровождением инновационных и научно-технических проектов на ранних стадиях их развития.